Soojustorudel on oma olemuselt mõned põhipiirangud:
1. Soojusülekandevõime piirang:Soojustorud ei pruugi sobida suure võimsusega rakendustele nende piiratud soojusülekandevõime tõttu. Sellised asjaolud võivad nõuda täiendavaid jahutusmehhanisme.
2. Orienteerumistundlikkus:Soojustorud on oma orientatsiooni suhtes tundlikud. Valesti paigutatuna ei pruugi need tõhusalt töötada.
3. Keskkonnategurite tundlikkus:Soojustorud on ka väga tundlikud keskkonnategurite suhtes, nagu rõhk ja temperatuur, mis võivad mõjutada nende jõudlust.
4. Piiratud temperatuurivahemik:Soojustorudel on piiratud temperatuurivahemik, mille jooksul need tõhusalt töötavad. Väljaspool seda vahemikku võib nende jõudlus halveneda.
5. Tahi struktuuri piiratud ühilduvus:Nende kasutamine võib teatud juhtudel olla piiratud soojustorudega töötavate tahikonstruktsioonide tüüpide piirangute tõttu.
6. Tootmise keerukus:Soojustorusid ei pruugita mõnes tööstusharus laialdaselt kasutada, kuna neid on keeruline valmistada.